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Different atmospheric methane-oxidizing communities in European beech and Norway spruce soils

Titelangaben

Degelmann, Daniela M. ; Borken, Werner ; Drake, Harold L. ; Kolb, Steffen:
Different atmospheric methane-oxidizing communities in European beech and Norway spruce soils.
In: Applied and Environmental Microbiology. Bd. 76 (2010) Heft 10 . - S. 3228-3235.
ISSN 1098-5336
DOI: https://doi.org/10.1128/AEM.02730-09

Abstract

Norway spruce (Picea abies) forests exhibit lower annual atmospheric methane consumption rates than do European beech (Fagus sylvatica) forests. In the current study, pmoA (encodes a subunit of membrane-bound CH4 monooxygenase) genes from three temperate forest ecosystems with both beech and spruce stands were analyzed to assess the potential effect of tree species on methanotrophic communities. A pmoA sequence difference of 7% at the derived protein level correlated with the species-level distance cut-off value of 3% based on the 16S rRNA gene. Applying this distance cut-off, higher numbers of species-level pmoA genotypes were detected in beech than in spruce soil samples, all affiliating with upland soil cluster  (USC). Additionally, two deep branching genotypes (named 6 and 7) were present in various soil samples not affiliating with both pmoA or amoA. Abundance of USCα pmoA genes was higher in beech soils and reached up to (1.2 ± 0.2) ×108 pmoA genes gDW-1. Calculated atmospheric methane oxidation rates per cell yielded the same trend. However, these values were below the theoretical threshold necessary for facilitating cell maintenance, suggesting that USCα species might require alternative carbon or energy sources to thrive in forest soils. These collective results indicate that the methanotrophic diversity and abundance in spruce soils are lower than those of beech soils, suggesting that tree species-related factors might influence the in situ activity of methanotrophs.

Weitere Angaben

Publikationsform: Artikel in einer Zeitschrift
Begutachteter Beitrag: Ja
Zusätzliche Informationen: BAYCEER80835
Institutionen der Universität: Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Biologie > Lehrstuhl Ökologische Mikrobiologie
Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Biologie > Lehrstuhl Ökologische Mikrobiologie > Lehrstuhl Ökologische Mikrobiologie - Univ.-Prof. Harold L. Drake, Ph.D.
Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Geowissenschaften > Lehrstuhl Bodenökologie
Forschungseinrichtungen > Forschungszentren > Bayreuther Zentrum für Ökologie und Umweltforschung - BayCEER
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Forschungseinrichtungen
Forschungseinrichtungen > Forschungszentren
Titel an der UBT entstanden: Ja
Themengebiete aus DDC: 500 Naturwissenschaften und Mathematik
Eingestellt am: 11 Sep 2015 06:32
Letzte Änderung: 11 Sep 2015 06:32
URI: https://eref.uni-bayreuth.de/id/eprint/19078