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Between-species differences in gene copy number are enriched among functions critical for adaptive evolution in Arabidopsis halleri

Titelangaben

Suryawanshi, Vasantika ; Talke, Ina N. ; Weber, Michael ; Eils, Roland ; Brors, Benedikt ; Clemens, Stephan ; Krämer, Ute:
Between-species differences in gene copy number are enriched among functions critical for adaptive evolution in Arabidopsis halleri.
In: BMC Genomics. Bd. 17 (22 Dezember 2016) Heft Suppl. 13 . - No. 1034.
ISSN 1471-2164
DOI: https://doi.org/10.1186/s12864-016-3319-5

Abstract

Gene copy number divergence between species is a form of genetic polymorphism that contributes significantly to both genome size and phenotypic variation. In plants, copy number expansions of single genes were implicated in cultivar- or species-specific tolerance of high levels of soil boron, aluminium or calamine-type heavy metals, respectively. Arabidopsis halleri is a zinc- and cadmium-hyperaccumulating extremophile species capable of growing on heavy-metal contaminated, toxic soils. In contrast, its non-accumulating sister species A. lyrata and the closely related reference model species A. thaliana exhibit merely basal metal tolerance.

Weitere Angaben

Publikationsform: Artikel in einer Zeitschrift
Begutachteter Beitrag: Ja
Zusätzliche Informationen: BAYCEER140640
Keywords: Copy number variation; Arabidopsis halleri; Metal hyperaccumulation; Cross-species; Array-CGH, Toll-Interleukin Receptor-Nucleotide Binding Site-Leucine Rich Repeat (TIR-NBS-LRR) protein family; Resistance genes (R genes); CNV
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Titel an der UBT entstanden: Nein
Themengebiete aus DDC: 500 Naturwissenschaften und Mathematik
500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften; Biologie
500 Naturwissenschaften und Mathematik > 580 Pflanzen (Botanik)
Eingestellt am: 09 Jan 2018 15:25
Letzte Änderung: 19 Jan 2018 07:56
URI: https://eref.uni-bayreuth.de/id/eprint/41556