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The universally-conserved transcription factor RfaH is recruited to a hairpin structure of the non-template DNA strand

Titelangaben

Zuber, Philipp ; Artsimovitch, Irina ; NandyMazumdar, Monali ; Liu, Zhaokun ; Nedialkov, Yuri ; Schweimer, Kristian ; Rösch, Paul ; Knauer, Stefan:
The universally-conserved transcription factor RfaH is recruited to a hairpin structure of the non-template DNA strand.
In: eLIFE. Bd. 7 (Mai 2018) .
ISSN 2050-084X
DOI: https://doi.org/10.7554/eLife.36349

Abstract

RfaH, a transcription regulator of the universally conserved NusG/Spt5 family, utilizes a unique mode of recruitment to elongating RNA polymerase to activate virulence genes. RfaH function depends critically on an ops sequence, an exemplar of a consensus pause, in the non-template DNA strand of the transcription bubble. We used structural and functional analyses to elucidate the role of ops in RfaH recruitment. Our results demonstrate that ops induces pausing to facilitate RfaH binding and establishes direct contacts with RfaH. Strikingly, the non-template DNA forms a hairpin in the RfaH:ops complex structure, flipping out a conserved T residue that is specifically recognized by RfaH. Molecular modeling and genetic evidence support the notion that ops hairpin is required for RfaH recruitment. We argue that both the sequence and the structure of the non-template strand are read out by transcription factors, expanding the repertoire of transcriptional regulators in all domains of life.

Weitere Angaben

Publikationsform: Artikel in einer Zeitschrift
Begutachteter Beitrag: Ja
Institutionen der Universität: Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie > Ehemalige Professoren > Lehrstuhl Biopolymere - Univ.-Prof. Dr. Paul Rösch
Fakultäten
Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften
Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie
Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie > Ehemalige Professoren
Titel an der UBT entstanden: Ja
Themengebiete aus DDC: 500 Naturwissenschaften und Mathematik > 500 Naturwissenschaften
500 Naturwissenschaften und Mathematik > 540 Chemie
Eingestellt am: 21 Dec 2018 08:01
Letzte Änderung: 30 Jan 2019 09:35
URI: https://eref.uni-bayreuth.de/id/eprint/46333