Literatur vom gleichen Autor/der gleichen Autor*in
plus bei Google Scholar

Bibliografische Daten exportieren
 

α-Helix nucleation by a calcium-binding peptide loop

Titelangaben

Siedlecka, Monika ; Goch, Grażyna ; Ejchart, Andrzej ; Sticht, Heinrich ; Bierzyǹski, Andrzej:
α-Helix nucleation by a calcium-binding peptide loop.
In: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Bd. 96 (1999) Heft 3 . - S. 903-908.
ISSN 1091-6490
DOI: https://doi.org/10.1073/pnas.96.3.903

Abstract

A 12-residue peptide AcDKDGDGYISAAENH2 analogous to the third calcium-binding loop of calmodulin strongly coordinates lanthanide ions (K = 105 M−1). When metal saturated, the peptide adopts a very rigid structure, the same as in the native protein, with three last residues AAE fixed in the α-helical conformation. Therefore, the peptide provides an ideal helix nucleation site for peptide segments attached to its C terminus. NMR and CD investigations of peptide AcDKDGDGYISAAEAAAQNH2 presented in this paper show that residues A13-Q16 form an α-helix of very high stability when the La3+ ion is bound to the D1-E12 loop. In fact, the lowest estimates of the helix content in this segment give values of at least 80% at 1°C and 70% at 25°C. This finding is not compatible with existing helix-coil transition theories and helix propagation parameters, s, reported in the literature. We conclude, therefore, that the initial steps of helix propagation are characterized by much larger s values, whereas helix nucleation is even more unfavorable than is believed. In light of our findings, thermodynamics of the nascent α-helices is discussed. The problem of CD spectra of very short α-helices is also addressed.

Weitere Angaben

Publikationsform: Artikel in einer Zeitschrift
Begutachteter Beitrag: Ja
Institutionen der Universität: Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie > Ehemalige Professoren > Lehrstuhl Biopolymere - Univ.-Prof. Dr. Paul Rösch
Fakultäten
Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften
Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie
Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie > Ehemalige Professoren
Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie > Lehrstuhl Biochemie mit Schwerpunkt Biophysikalische Chemie
Titel an der UBT entstanden: Ja
Themengebiete aus DDC: 500 Naturwissenschaften und Mathematik > 540 Chemie
500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften; Biologie
Eingestellt am: 23 Jan 2019 11:13
Letzte Änderung: 05 Sep 2022 07:28
URI: https://eref.uni-bayreuth.de/id/eprint/46999