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ScatterJn : An ImageJ Plugin for Scatterplot-Matrix Analysis and Classification of Spatially Resolved Analytical Microscopy Data

Titelangaben

Zeitvogel, Fabian ; Obst, Martin:
ScatterJn : An ImageJ Plugin for Scatterplot-Matrix Analysis and Classification of Spatially Resolved Analytical Microscopy Data.
In: Journal of Open Research Software. Bd. 4 (2016) Heft 1 . - e5.
ISSN 2049-9647
DOI: https://doi.org/10.5334/jors.89

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Abstract

We present ScatterJn, an ImageJ (and Fiji) plugin for scatterplot-based exploration and analysis of analytical microscopy data. In contrast to commonly used scatterplot tools, it handles more than two input images (or image stacks, respectively) by creating a matrix of pairwise scatterplots. The tool offers the possibility to manually classify pixels by selecting regions of datapoints in the scatterplots as well as in the spatial domain. We demonstrate its functioning using a set of elemental maps acquired by SEM-EDX mapping of a soil sample. The plugin is available at https://savannah.nongnu.org/projects/scatterjn.

Weitere Angaben

Publikationsform: Artikel in einer Zeitschrift
Begutachteter Beitrag: Ja
Zusätzliche Informationen: BAYCEER135304
Institutionen der Universität: Forschungseinrichtungen
Forschungseinrichtungen > Forschungszentren
Forschungseinrichtungen > Forschungszentren > Bayreuther Zentrum für Ökologie und Umweltforschung - BayCEER
Titel an der UBT entstanden: Ja
Themengebiete aus DDC: 500 Naturwissenschaften und Mathematik
Eingestellt am: 05 Aug 2016 10:57
Letzte Änderung: 05 Aug 2016 10:57
URI: https://eref.uni-bayreuth.de/id/eprint/33853