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Wöhrl, Birgitta M. ; Tantillo, Chris ; Arnold, Edward ; Le Grice, Stuart F.J.:
An Expanded Model of Replicating Human Immunodeficiency Virus Reverse Transcriptase.
In: Biochemistry.
Bd. 34
(1995)
Heft 16
.
- S. 5343-5350.
ISSN 1520-4995
DOI: https://doi.org/10.1021/bi00016a005
Abstract
Replication complexes containing wild-type and RNase H-deficient p66/p51 human immunodeficiency virus type 1 reverse transcriptase(HIV-1 RT)were analyzed by DNase I and SI footprinting. While crystallography and chemical footprinting data demonstrate that 15-18 bases of primer and template occupy the DNA polymerase and RNase H active centers, enzymatic footprinting suggests that a larger portion of substrate is encompassed by the replicating enzyme. Independent of the position of DNA synthes is arrest, template nucleotides +7 to -23 and primer nucleotides -1 to -25 are nuclease resistant. On both DNA strands, position -20 remains accessible to DNase I cleavage, suggestive of an alteration in nucleic acid structure between exiting the RNase H catalytic center and leaving the C-terminal p66 domain. A model of HIV-1 RT containing an extended single-stranded template and duplex region was constructed on the basis of the structure of an RT/DNA complex. Mapping of footprint data onto this model shows consistency between biochemical and structural data, implicating a contribution from domains proximal to the catalytic centers.
Weitere Angaben
| Publikationsform: | Artikel in einer Zeitschrift |
|---|---|
| Begutachteter Beitrag: | Ja |
| Institutionen der Universität: | Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie > Lehrstuhl Biochemie mit Schwerpunkt Biophysikalische Chemie Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie > Ehemalige Professoren > Lehrstuhl Biopolymere - Apl. Prof. Dr. Birgitta Wöhrl Fakultäten Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie > Ehemalige Professoren |
| Titel an der UBT entstanden: | Nein |
| Themengebiete aus DDC: | 500 Naturwissenschaften und Mathematik > 540 Chemie 500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften; Biologie |
| Eingestellt am: | 20 Mai 2019 07:56 |
| Letzte Änderung: | 20 Mai 2019 07:56 |
| URI: | https://eref.uni-bayreuth.de/id/eprint/48998 |