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Solution structure of the DNA-binding domain of the yeast transcriptional activator protein GCN4

Titelangaben

Saudek, Vladimir ; Pastore, Annalisa ; Castiglione Morelli, Maria A. ; Frank, Rainer ; Gausepohl, Heinrich ; Gibson, Toby ; Weih, Falk ; Rösch, Paul:
Solution structure of the DNA-binding domain of the yeast transcriptional activator protein GCN4.
In: Protein Engineering, Design & Selection. Bd. 4 (1990) Heft 1 . - S. 3-10.
ISSN 1741-0134
DOI: https://doi.org/10.1093/protein/4.1.3

Abstract

The solution structure of an active synthetic peptide containing both the leucine zipper and the adjacent basic domain of the yeast transcription factor GCN4 (residues 220–280) was determined by NMR. The two domains show structurally distinct behaviours. In the absence of DNA, the basic domain is, although very flexible, structured and fluctuating around a helical conformation. The leucine zipper region forms a long, uninterrupted helix. From a suitable set of NMR distances the three-dimensional structure of the leucine zipper monomeric sub-domain was calculated by distance geometry algorithms. The structure of the symmetrical parallel dimer was obtained by model building using the NMR information. A smaller peptide with the sequence of the isolated basic region (residues 1–35 of the 61 residue peptide) was also synthesized. Circular dichroism studies showed 30–40% helicity. A flexible helix spans the region between residues 8 and 21. The comparison of our results with suggested models is discussed in detail.

Weitere Angaben

Publikationsform: Artikel in einer Zeitschrift
Begutachteter Beitrag: Ja
Institutionen der Universität: Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie > Ehemalige Professoren > Lehrstuhl Biopolymere - Univ.-Prof. Dr. Paul Rösch
Fakultäten
Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften
Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie
Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie > Ehemalige Professoren
Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie > Lehrstuhl Biochemie mit Schwerpunkt Biophysikalische Chemie
Titel an der UBT entstanden: Nein
Themengebiete aus DDC: 500 Naturwissenschaften und Mathematik > 540 Chemie
500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften; Biologie
Eingestellt am: 21 Dec 2018 08:17
Letzte Änderung: 31 Aug 2021 07:50
URI: https://eref.uni-bayreuth.de/id/eprint/46765