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Ryabchykov, Oleg ; Bocklitz, Thomas ; Ramoji, Anuradha ; Neugebauer, Ute ; Foerster, Martin ; Kroegel, Claus ; Bauer, Michael ; Kiehntopf, Michael ; Popp, Jürgen:
Automatization of spike correction in Raman spectra of biological samples.
In: Chemometrics and Intelligent Laboratory Systems.
Bd. 155
(2016)
.
- S. 1-6.
ISSN 1873-3239
DOI: https://doi.org/10.1016/j.chemolab.2016.03.024
Abstract
Raman spectroscopy as a technique has high potential for biological applications, e.g. cell and tissue analysis. In these applications, large data sets are normally recorded which require automated analysis. Unfortunately, a lot of disturbing external influences exist, which negatively affect the analysis of Raman spectra. A problematic corrupting effect in big data sets is cosmic ray noise, which usually produces intense spikes within the Raman spectra. In order to exploit Raman spectroscopy in real world applications, detection and removing of spikes should be stable, data-independent and performed without manual control. Herein, an automatic algorithm for cosmic ray noise correction is presented. The algorithm distinguishes spikes from spectra based on their response to a Laplacian, e.g. their sharpness. Manual rating of the spike presence was used as a benchmark for algorithm validation. The algorithm's sensitivity was estimated to be above 99%.
Weitere Angaben
| Publikationsform: | Artikel in einer Zeitschrift |
|---|---|
| Begutachteter Beitrag: | Ja |
| Institutionen der Universität: | Fakultäten > Fakultät für Mathematik, Physik und Informatik > Institut für Informatik > Lehrstuhl Künstliche Intelligenz in der Mikroskopie und Spektroskopie > Lehrstuhl Künstliche Intelligenz in der Mikroskopie und Spektroskopie - Univ.-Prof. Dr. Thomas Wilhelm Bocklitz Fakultäten Fakultäten > Fakultät für Mathematik, Physik und Informatik Fakultäten > Fakultät für Mathematik, Physik und Informatik > Institut für Informatik Fakultäten > Fakultät für Mathematik, Physik und Informatik > Institut für Informatik > Lehrstuhl Künstliche Intelligenz in der Mikroskopie und Spektroskopie |
| Titel an der UBT entstanden: | Nein |
| Themengebiete aus DDC: | 500 Naturwissenschaften und Mathematik > 530 Physik |
| Eingestellt am: | 15 Mai 2023 12:04 |
| Letzte Änderung: | 07 Sep 2023 13:47 |
| URI: | https://eref.uni-bayreuth.de/id/eprint/76361 |