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Integrative Structural Biology of Protein-RNA Complexes

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Dimitrova-Paternoga, Lyudmila ; Jagtap, Pravin Kumar Ankush ; Chen, Po-Chia ; Hennig, Janosch:
Integrative Structural Biology of Protein-RNA Complexes.
In: Structure. Bd. 28 (2020) Heft 1 . - S. 6-28.
ISSN 0969-2126
DOI: https://doi.org/10.1016/j.str.2019.11.017

Abstract

Ribonucleoprotein complexes (RNPs) are central to all processes in the cell. One of the prerequisites to understand how RNPs work is to determine their high-resolution structures. With the recent revolution in cryoelectron microscopy this task has become easier for large RNP machines, such as ribosomes, spliceosomes, and polymerases. However, the transient and highly dynamic nature of many RNPs makes structure determination a challenging task. Thus, an integrative structural and molecular biology approach is required, tackling three key challenges: (1) identification of cognate RNA sequences; (2) collection of structural data by conducting X-ray crystallography, NMR, electron microscopy, small-angle scattering (SAS), and other experiments; and (3) the creation of structural models that integrates all experimental restraints. Given the breadth of expertise required, this review presents an overview of available methods and successful examples with the goal to provide readers with a selection of promising options for structure determination of RNPs.

Weitere Angaben

Publikationsform: Artikel in einer Zeitschrift
Begutachteter Beitrag: Ja
Keywords: NMR; RNA; RNA binding domain; RNA binding protein; RNA motif identification; RNA recognition; RNP; integrative structural biology; protein-RNA complexes; structural biology; structure modeling
Institutionen der Universität: Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie > Lehrstuhl Biochemie IV - Biophysikalische Chemie > Lehrstuhl Biochemie IV - Biophysikalische Chemie - Univ.-Prof. Dr. Janosch Hennig
Fakultäten
Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften
Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie
Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie > Lehrstuhl Biochemie IV - Biophysikalische Chemie
Forschungseinrichtungen > Zentrale wissenschaftliche Einrichtungen > Nordbayerisches Zentrum für NMR-Spektroskopie - NMR-Zentrum
Titel an der UBT entstanden: Nein
Themengebiete aus DDC: 500 Naturwissenschaften und Mathematik > 540 Chemie
500 Naturwissenschaften und Mathematik > 570 Biowissenschaften; Biologie
Eingestellt am: 06 Okt 2021 10:53
Letzte Änderung: 26 Sep 2024 07:26
URI: https://eref.uni-bayreuth.de/id/eprint/67206