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Model order reduction for the TASEP Master equation

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Pioch, Kilian ; Kriecherbauer, Thomas ; Margaliot, Michael ; Grüne, Lars:
Model order reduction for the TASEP Master equation.
Bayreuth ; Tel Aviv , 2024 . - 7 S.
DOI: https://doi.org/10.48550/arXiv.2402.10234

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Projekttitel:
Offizieller Projekttitel
Projekt-ID
Analysis of Random Transport in Chains using Modern Tools from Systems and Control Theory
GR 1569/24-1, KR 1673/7-1

Projektfinanzierung: Deutsche Forschungsgemeinschaft

Abstract

The totally asymmetric simple exclusion process (TASEP) is a stochastic model for the unidirectional dynamics of interacting particles on a 1D-lattice that is much used in systems biology and statistical physics. Its master equation describes the evolution of the probability distribution on the state space. The size of the master equation grows exponentially with the length of the lattice. It is known that the complexity of the system may be reduced using mean field approximations. We provide a rigorous derivation and a stochastic interpretation of these approximations and present numerical results on their accuracy for a number of relevant cases.

Weitere Angaben

Publikationsform: Preprint, Postprint
Begutachteter Beitrag: Ja
Keywords: Stochastic systems; systems biology; model reduction; Markov process; interacting particle systems; moment closure; pair-approximation
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Forschungseinrichtungen > Zentrale wissenschaftliche Einrichtungen > Bayreuther Zentrum für Modellierung und Simulation (MODUS)
Titel an der UBT entstanden: Ja
Themengebiete aus DDC: 500 Naturwissenschaften und Mathematik > 510 Mathematik
Eingestellt am: 20 Feb 2024 07:23
Letzte Änderung: 20 Feb 2024 07:23
URI: https://eref.uni-bayreuth.de/id/eprint/88652