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Chemical probing of the human sirtuin 5 active site reveals its substrate acyl specificity and peptide-based inhibitors

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Roessler, Claudia ; Nowak, Theresa ; Pannek, Martin ; Gertz, Melanie ; Nguyen, Giang Thi Tuyet ; Scharfe, Michael ; Born, Ilona ; Sippl, Wolfgang ; Steegborn, Clemens ; Schutkowski, Mike:
Chemical probing of the human sirtuin 5 active site reveals its substrate acyl specificity and peptide-based inhibitors.
In: Angewandte Chemie International Edition. Bd. 53 (2014) Heft 40 . - S. 10728-10732.
ISSN 1521-3773
DOI: https://doi.org/10.1002/anie.201402679

Abstract

Sirtuins are NAD(+)-dependent deacetylases acting as sensors in metabolic pathways and stress response. In mammals there are seven isoforms. The mitochondrial sirtuin 5 is a weak deacetylase but a very efficient demalonylase and desuccinylase; however, its substrate acyl specificity has not been systematically analyzed. Herein, we investigated a carbamoyl phosphate synthetase 1 derived peptide substrate and modified the lysine side chain systematically to determine the acyl specificity of Sirt5. From that point we designed six potent peptide-based inhibitors that interact with the NAD(+) binding pocket. To characterize the interaction details causing the different substrate and inhibition properties we report several X-ray crystal structures of Sirt5 complexed with these peptides. Our results reveal the Sirt5 acyl selectivity and its molecular basis and enable the design of inhibitors for Sirt5.

Weitere Angaben

Publikationsform: Artikel in einer Zeitschrift
Begutachteter Beitrag: Ja
Zusätzliche Informationen: PubMed-ID: 25111069
Institutionen der Universität: Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie > Lehrstuhl Biochemie > Lehrstuhl Biochemie I - Proteinbiochemie der Signaltransduktion - Univ.-Prof. Dr. Clemens Steegborn
Fakultäten
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Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie
Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Chemie > Lehrstuhl Biochemie
Titel an der UBT entstanden: Ja
Themengebiete aus DDC: 500 Naturwissenschaften und Mathematik > 540 Chemie
Eingestellt am: 20 Apr 2015 14:21
Letzte Änderung: 02 Nov 2023 14:08
URI: https://eref.uni-bayreuth.de/id/eprint/10431