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Palmer, Katharina ; Drake, Harold L. ; Horn, Marcus A.:
Genome-derived criteria for assigning environmental narG and nosZ sequences to operational taxonomic units of nitrate reducers.
In: Applied and Environmental Microbiology.
Bd. 75
(2009)
Heft 15
.
- S. 5170-5174.
ISSN 1098-5336
DOI: https://doi.org/10.1128/AEM.00254-09
Abstract
Ninety percent of cultured bacterial nitrate reducers with a 16S rRNA gene similarity of >97% had a narGor nosZ similarity of >67% or >80%, respectively, suggesting that 67% and 80% could be used as standardized,conservative threshold similarity values for narG and nosZ, respectively (i.e., any two sequences that are lesssimilar than the threshold similarity value have a very high probability of belonging to different species), forestimating species-level operational taxonomic units. Genus-level tree topologies of narG and nosZ weregenerally similar to those of the corresponding 16S rRNA genes. Although some genomes contained multiplecopies of narG, recent horizontal gene transfer of narG was not apparent.
Weitere Angaben
| Publikationsform: | Artikel in einer Zeitschrift |
|---|---|
| Begutachteter Beitrag: | Ja |
| Zusätzliche Informationen: | BAYCEER72367 |
| Institutionen der Universität: | Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Biologie > Lehrstuhl Ökologische Mikrobiologie Forschungseinrichtungen > Forschungszentren > Bayreuther Zentrum für Ökologie und Umweltforschung - BayCEER Fakultäten Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Biologie Forschungseinrichtungen Forschungseinrichtungen > Forschungszentren |
| Titel an der UBT entstanden: | Ja |
| Themengebiete aus DDC: | 500 Naturwissenschaften und Mathematik |
| Eingestellt am: | 29 Jul 2015 05:53 |
| Letzte Änderung: | 21 Jul 2021 06:24 |
| URI: | https://eref.uni-bayreuth.de/id/eprint/17374 |