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Application of a newly developed ARB software-integrated tool for in silico terminal restriction fragment length polymorphism analysis reveals the dominance of a novel pmoA cluster in a forest soil

Titelangaben

Ricke, Peter ; Kolb, Steffen ; Braker, Gesche:
Application of a newly developed ARB software-integrated tool for in silico terminal restriction fragment length polymorphism analysis reveals the dominance of a novel pmoA cluster in a forest soil.
In: Applied and Environmental Microbiology. Bd. 71 (2005) Heft 3 . - S. 1671-1673.
ISSN 1098-5336
DOI: https://doi.org/10.1128/AEM.71.3.1671-1673.2005

Abstract

TRF-CUT, an ARB-implemented tool, was developed to predict in silico the terminal restriction fragmentsof aligned small-subunit rRNA gene or functional gene sequences. Application of this new tool to performdirected terminal restriction fragment length polymorphism analysis of pmoA products obtained from a forestsoil revealed that novel cluster I methanotrophic bacteria were dominant.

Weitere Angaben

Publikationsform: Artikel in einer Zeitschrift
Begutachteter Beitrag: Ja
Zusätzliche Informationen: BAYCEER26215
Institutionen der Universität: Forschungseinrichtungen > Forschungszentren > Bayreuther Zentrum für Ökologie und Umweltforschung - BayCEER
Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Biologie > Lehrstuhl Ökologische Mikrobiologie
Fakultäten
Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften
Fakultäten > Fakultät für Biologie, Chemie und Geowissenschaften > Fachgruppe Biologie
Forschungseinrichtungen
Forschungseinrichtungen > Forschungszentren
Titel an der UBT entstanden: Ja
Themengebiete aus DDC: 500 Naturwissenschaften und Mathematik
Eingestellt am: 29 Jul 2015 05:53
Letzte Änderung: 29 Jul 2015 05:53
URI: https://eref.uni-bayreuth.de/id/eprint/17422