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Structural rearrangements on HIV-1 Tat (32-72) TAR complex formation

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Metzger, Armin U. ; Schindler, Thomas ; Willbold, Dieter ; Kraft, Margot ; Steegborn, Clemens ; Volkmann, Andrea ; Frank, Rainer W. ; Rösch, Paul:
Structural rearrangements on HIV-1 Tat (32-72) TAR complex formation.
In: FEBS Letters. Bd. 384 (1996) Heft 3 . - S. 255-259.
ISSN 1873-3468
DOI: https://doi.org/10.1016/0014-5793(96)00314-6

Abstract

Expression of the early genes of the human immunodeficiency virus type-I (HIV-1) genome is under the control of a trans-activator (Tat) protein. HIV-1 Tat action requires binding to TAR (trans-activation responsive element), an RNA sequence located at the 5'-end of all lentiviral mRNAs. We used various spectroscopic methods to investigate conformational changes on HIV-1 TAR binding to the HIV-1 (32-72) Tat peptide BP1. It comprises the RNA binding region and binds specifically to TAR. We conclude from our experiments that the regular A-form of the TAR RNA is slightly distorted towards the B-form when bound to BP1. Thus, the major groove is widened and the binding of BP1 facilitated. BP1 presumably adopts an extended conformation when binding to TAR and may fit well into the TAR major groove.

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Publikationsform: Artikel in einer Zeitschrift
Begutachteter Beitrag: Ja
Zusätzliche Informationen: PubMed-ID: 8617366
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Titel an der UBT entstanden: Ja
Themengebiete aus DDC: 500 Naturwissenschaften und Mathematik > 540 Chemie
Eingestellt am: 10 Apr 2015 10:12
Letzte Änderung: 31 Mär 2022 13:31
URI: https://eref.uni-bayreuth.de/id/eprint/9983